Dudo que vaya a pasar nada. Si hubiera expirado el plazo para presentar esa documentación (que te han dicho que no hay, pero haces bien en dudar; hay demasiado funcionario que no se entera de nada), habrías recibido una carta de la secretaría de tu facultad informándote de ello y dándote un plazo para entregarlos, después del cual procederían a anularte de oficio la matrícula (y, quizás, a devolverte el dinero).
Pero, desde luego, no te van a "cortar la cabeza" a la de YA sin avisar.
Un saludo.