El principal problema, como bien han dicho, es la propia caja más que el HDD. El motivo es que los drivers usados por los cIOS contemplan en su gran mayoria dispositivos USB puros y muchas veces no contemplan las cajas USB-HDD, que aunque se conecten de manera parecida, son bien diferentes.
Una posible solución puede ser probar el uLoader con el cIOS 222. De todos los usbloaders diferentes que hay, es el que más compatibilidad con diferentes HDD tiene.