Wenas!!!
Antes de borrar nada, puedes probar ese disco duro en otra ps2, con otro adaptador de red, pues puede que el problema no este en el disco duro.
Si sigue dando problemas y el disco duro te lo reconoce el pc, y te da igual perder los datos, lo que puedes hacer es formatearlo en NTFS y volver a conectarlo a la ps2 para que te lo formatee en formato HDLOADER y volver a empezar.
Espero que puedas arreglarlo.
Salu2