PUes la principal esq si por ej flasheas la gcos ya no podras cambiar de bios. Por el resto.... pues nada, pq mientras te quedes en la cobra siempre puedes flashear desde ella.
Esto todo suponiendo q es el Viper GC, en el q el programador solo sirve para flashear bios, si fuera el Viper Extreme, pues te pierdes mucho mas pq se pueden hacer muchas cosas por USB.