No se puede cambiar durante el juego la elección de una gemma u otra. La gemma dorada te permite volver a empezar desde el punto de control al fallar una misión las veces que quieras (Los objetos gastados en un intento no vuelven a aparecer) y la gemma amarilla te permite renacer con una gemma amarilla al perder vida. Cual es mejor? Depende de lo bueno/malo que seas. Si pierdes mucho mejor la dorada, pero si aguantas bien y solo te cuestan los malos finales pues la amarilla.