Como mencionaron arriba, uso el HDL con el parche 0.6d y el juego funciona perfecto, sin necesidad de utilizar algunos de los 6 MODOS ni tener que ponerle parche al juego.
Para parcheralo es muy facil, puedes conseguir un archivo PPF y con el PPF-o-Matic le aplicas la modificacion de forma automatica o a mano, que es lo que mencionas en tu mensaje, donde estas modificando directamente los bits de un archivo imagen del disco -generalmente ISO- con un editor hexadecimal, donde buscas una cadena en particular y la sustituyes, en el caso de ser el disco del juego.
O en tu caso estas modificando directamente el programa HDL limpio -es decir, sin haber sufrido ninguna modificacion - y que no este "empaquetado/comprimido" -Unpack-, este ocupa ~2.9MB, si lo vas a usar en una MC debes de "empaquetarlo" para que ocupe menos espacio con el PS2 Packer 0.4 o 0.4.4 despues de haberlo modificado con el parche o a mano.