Los bats son unos scripts para el ejecutable y te crea así el disco con los datos especificos. No puedes grabar los datos a pelo, tienes que crearlos con el bat para sacar la ISO. Si abres el bat pal con un editor de textos (gedit, kedit...) quizás te vengan los parametros a usar para crear la iso y con wine puedas ejecutarlos directamente sobre el ejecutable.