Buenas, para el shining soul no tengo ni idea, pero para el sword of mana, me pasaba igual q a ti y desde ace 5 minutos e descubierto la formula xD (kizas valga para el shining soul 2 tb, no lo se, todo es probar).
Haz lo siguiente:
Abre el M3 Game Manager, señalas la direccion dnd kieras k vaya la copia de seguridad (la Rom)
Write Gba, señalas la rom, y tendras k insertarle un Path.
en dnd pone Gba Path, esta por defecto Soft Path, cambialo a Hardware Support 1, dale a Ok, y ya podras grabar.
Espero poder haberte ayudado, saludos.