Si, pero supongo que el hecho de que no arranque desde ahí es porque solo permite el arranque desde un dispositivo directamente conectado al southbridge como es un disco SATA o un dispositivo USB, pero no permite el arranque desde un dispositivo adaptador por PCI-Express.
De todos modos si consigues arrancar desde PCI-Express-SATA3 te agradecería que lo comentaras por aquí.
Muchas gracias de nuevo!