Si te has cargado el lector al flashearlo, puedes intentar restaurarlo con el kit de Flash78, con tu firm original (k previamente debias haber extraido),xk para cambiar el lector necesitas la key del tuyo, y metersela al nuevo, xk si no no funcionara; si no es x eso, y simplemente el lector no te funciona, siempre puedes recurrir al SAT.
SAlu2
Edito: Pero tu problema es de lector, o de 3 luces rojas?, xk si es esto ultimo, no tiene xk ser el lector, es +, lo + probable es k se te halla kemado(o tenga algun problema gordo), y tengas k mandarla al SAT.