guardar configuracion

ola buenas, tengo un "pequeño" problema con gnu/linux

resulta que configuro todo el sistema ( resolución de pantalla,
drivers tarjeta de sonido, montar particiones de los discos
duros.......) todo ello desde la sesión de usuario normal, bien pues
resulta que al reinciar se pierde toda la configuración y me toca
volver a ajustar todo, hay alguna manera de que se salve?

lo único "fuera de lo normal" es que tengo grub en un diskete, pues si
lo tengo en el disco duro, no me deja iniciar windows (lo necesito
para la uni).

la distri que uso es debian etch 4.0 y uso kde.

lo de la tarjeta de sonido y las particiones las hago desde una consola de root y lo de la resolución de pantalla lo hago dsede la sesión de usuario

saludos
pues ni idea macho, qué cosa más rara... lo que no entiendo es que tengas GRUB en un diskette para poder arrancar win... se puede tener en el disco duro y que te saque un menú de arranque.
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