Claro que puedes. Si sólo quieres mensajes y agenda, es muy simple.
Para la agenda, vete a la libreta de direcciones y a herramientas--exportar. Se guarda en formato ldif. Para restaurarla lo haces con importar. Mira bien que tengas todos los contactos en la misma libreta o si no haz una copia por libreta.
Y para los mensajes vete a configuración de cuentas y a tu cuenta--configuración del servidor. Verás que abajo dice "directorio local". Esa es la ruta donde están tus cosas. Copia el contenido y cuando reinstales déjalo donde quieras y le dices a directorio local que apunte allí.
Si por casualidad tus mensajes estuviesen bajo "carpetas locales", usa la dirección de directorio local de esa cuenta.
En la carpeta donde están los mensajes habrá por cada carpeta un fichero msf y uno sin extensión. Y si tienes carpetas anidadas, verás que la estructura es calcada en el directorio.
Saludos
