Yo creo que los cambios de color de pelo del Broly de los 90 se debían mas bien a errores a la hora de elegir los colores y ya esta... No le buscaría mucha mas lógica, a día de hoy si tuvieran que volver a dibujarlo en su estado SSJ Legendario seria con el color verde seguro.
Exceptuando en el regreso de Broly cuando comienza luchando en su estado SSj normal, ya que a diferencia de la primera película ya no tiene el control mental de Paragus y puede transformarse sin restricciones.
Supongo que en su día, quisieron diferenciar a Broly del resto de saiyans, ya sea con su color azul como SSJ restringido o verde cuando liberaba todo su poder, y a día de hoy con Super se ha canonizado el verde como SSJ legendario.
Pero vamos, que no le daría yo mas vueltas...