La única ventaja del Trucha es que puedes modificar juegos de Wii, como por ejemplo descensurar el Manhunt 2 o el No More Heroes, añadir musicas o voces distintas a los juegos, traducir juegos, etc.
Pero para homebrew no hay diferencia, lo único que con Trucha podrias ejecutar los emuladores, reproductores, etc, desde un DVD que contenga el ejecutable, y si ese ejecutable necesita ficheros extra no te los leera desde el DVD, lo intentará hacer siempre desde la SD. Así que no aporta muchas ventajas ejecutar homebrew desde el DVD.
Mi consejo si solo quieres homebrew: Que te pilles el Twilight y te instales el Canal Homebrew, y ejecutes todo el homebrew de Wii desde la SD.
Saludos.