Weno, veamos, voy a explayarme:
**Pekeña guia**
Bien, una vez te encargas de Blaine en el gimnasio de Isla Canela, puedes ir a las primeras 3 islas del archipielago este de marras. Bien, las recorres y cuando te hartes acaba tu recorrido por Kanto (es decir, ve a la Liga Pokemon y acaba con todos). Una vez terminado, recibiras un nuevo ticket de barco y podras dirigirte hacia las islas 4, 5, 6 y 7 del archipielago, para resolver un misterio relacionado con el Team Rocket. En medio del barullo encontraras 2 piedras, que serviran para que no recuerdo quien, active una maquina para que puedas pasar los pokemon de Rubi/Zafiro a tu Rojo/Verde. Tambien deberias de poder capturar a los pokemon de johto.
Tambien en una de las islas esta esccondido Moltres, asi que ya sabeis, a por el. Otros lugares interesantes de estas islas es la Torre de Batalla y la cueva de los Unown.
Una vez solucionado todo el misterio, regresa a la Liga Pokemon y veras que los entrenadores tienen Pokemon de la region de Johto. Derrotalos de nuevo a todos y tendras acceso por fin a la Mazmorra Rara (Ciudad Celeste) donde espera a ser atrapado MewTwo.
PD: Existen 2 islas mas en el archipielago, las slas 8 y 9. En ellas residen 3 pokemon legendarios: en la 8, Lugia y Ho-oh y en la 9, Deoxys. Solo se pueden llegar a estas islas con 2 Tickets de barco que Nintendo distribuira como hizo con el Ticket Eon de Rubi/Zafiro.
PD2: Tambien, cuando te pases por primera vez la liga pokemon, se liberara uno de los tres perros legendarios de Oro/Plata (Entei, Raikou o Suicune). El perro liberado sera del tipo opuesto a tu Pokemon de inicio.
Suerte! Para mas dudas aki estoy!