El sistema para atrapar pokemon funciona exactamente como dice Kingcr0ss.
Creo que es algo evidente... pero lo explico por si hay dudas.
Cada pokemon tiene un % fijo de captura (algunos tienen un triste 5%, otros 50%, 60%...), que se muestra en color naranja en la barra de captura. Después, si te sobran turnos, también aumenta el % de captura (dependiendo del combate, algunos turnos te podrán dar más o menos %, no tienen un valor fijo), y se muestra en color amarillo. Si falla la captura, y se tienen suficientes monedas, te dan la opción de comprar una super ball que dobla el % de captura y se muestra en color azul.
Espero haberlo explicado bien y que se entienda.