Creo que desde el firm 9.0 (no estoy seguro, pero recientemente), las actualizaciones de los juegos se pueden realizar directamente desde el menú de sistema de la consola, sin necesidad de entrar en la eshop. Lo que desconozco es si solicitan último firm, pero juraría que no, que precisamente ese es el gran cambio, que al no obligar a entrar en la eshop, no obligan a actualizar.
Todo esto, cogedlo con pinzas, aunque pueda parecer lo contrario, ando bastante desconectado de la 3ds.
Saludos.