A ver, desconecta el Sata 1 y el 2, en el dos pones el disco duro que estaba en el uno y dejas ese solo, y en el 1 pones el lector de la 360.... mas sencillo imposible.
El unico pero es que tengas los 4 discos duros en RAID, entonces si, desconectes uno u otro, no te arranca windows.