Eso es porque aunque el DVD sea de mediados de octubre, el contenido que enviaron a grabar eran los de la beta de septiembre calificada ya como producto final, por lo tanto necesita todas las actualizaciones desde mediados de septiembre hasta finales de noviembre que se hicieron en la beta.
Por eso, si tienes la 4.0.3a instalada, no hace falta hacer nada, solo actualizar la cuenta en Battle.net, y al arrancar el juego el propio lanzador, te baja los datos que hagan falta, que no llegan 1GB.
La versión del DVD coincide con los datos de la 4.0.0 que introdujo los eventos de trols y gnomeregan, salvo que no tiene esos eventos, ni los mapas del viejo mundo, ni sonidos que ya no existen actualmente, ... Pero la estructura de datos es la misma, y el contenido cuando se actualiza a Cataclysm ese cliente sin instalar desde el DVD es el mismo, pero engordado con archivos que ya no se usan como OldWorld.MPQ y unos cuantos más.