Teoricamente la integrada (aunque tampoco demasiado) creo que se nota
más en RAID y cosas asi. Ten en cuenta que una cosa son los SATA
integrados en el chipset y otra los que van integrados en la placa con
un chip externo (promise, fastrack,...) estos ultimos tambien se conectan
al chiset por pci (por lo general) con lo que seran practicamente igual
que una tarjeta PCI.
Como ejemplo mi placa, tiene dos SATA en el chipset y otros dos en
una controlodora RAID, los integrados son más rápidos.
En el modelo /p4c800
Edeluxe los integrados en el chipset tambien
soportan RAID y en los benchmarks se notaba (al menos en un RAID
con discos de 10K rpm)
Para un uso normal la diferencia tampoco sera demasiado importante