Pues no, no todos los 5.1 tienen entrada coaxial, como ya te he dicho cuantas mas entradas/salidas tenga mas caro. Los hay desde lo que no tienen ni una sola entrada como el de mi prima hasta los que se le puede enchufar hasta la tostadora. Lo dicho, si vas a ir a mirar no te confies pensando que cualquier 5.1 va a tener las entradas que buscas porque no va a ser asi.
Como alternas entre aparatos? pues facil igual que haces en tu tele cuando quieres ver el dvd, habra un boton para elegir la fuente (source) y ya eliges si quieres que suene lo que entre por optico o lo que entre por coaxial, aunque weno, en mi caso hay un boton para cada entrada.
Un amplificador pues sirve para eso para amplificar la señal y que esta tenga mas potencia, lo que pasa es que los que son buenecillos pues ya llevan los decodificadores para tragarse dolby, dts, y demas siglas...
Para conectar por hdmi la ps3 y el ordenador primero has de ver si tu grafica tiene hdmi y si esta saca audio por el, y luego tendrias que buscar un amplificador/decodificador con dos entradas hdmi, cosa que no debe ser naaaada barata, y por ultimo buscar unos altavoces. Esta solucion no la veo yo porque debe ser bastante cara, pero bueno, para gustos los colores. No hace falta decir que no estoy en posesion de la verdad absoluta y que quiza hayan bajado de precio los amplificadores/decodificadores con entradas hdmi, todo es mirarlo, comprar las distintas opciones y comprar lo que mejor se ajuste a tus necesidades.
Para mi lo mas comodo es como lo tengo puesto yo, tengo unos altavoces creative similares a los logitech que te puse (
http://www.elalmanaque.com/informatica/altavoces_creative.htm), con su decodificador y todo que compre hace ya 9 años lo menos pero que no ha sido hasta tener la ps3 cuando les estoy sacando todo el partido. Asi tengo la ps3 por optico, el ordenata por coaxial y el portatil por minijack.