Cuando a mi me ha pasado algo similar, y no tengo que estar mas de 48 horas sin trabajar, típica gastroenteritis o cagaleras, no me hace falta pedir la baja, simplemente el médico te da un parte en el que indica tu dolencia y la recomendación de reposo 24/48 horas y ya está. Si vas a estar más de dos días sin acudir al trabajo si necesitarías solicitar la baja.
El parte lo llevas cuando te reincorporas al trabajo y lleva fecha del día que no fuiste a trabajar, que es cuando debes ir al médico de cabecera.
Supongo que será igual en todas las empresas, seguro que el propio médico te puede asesorar, no serás el primer pizzero que se pone enfermo.