Vamos por partes:
Lo primero es que los phenomII no deben de pasar de 62ºC que recomienda el fabrincante, tu micro esta en peligro, tu preguntaras, por que pasa eso? pues lo mas probable sea por tu disipador, ya que esta tirando el aire caliente a la placa base y el procesador, lo que hace que se caliente, puedes poner un ventilador trasero (donde se ve el hueco) para que expulse el aire, y ya que quieres hacer moding, pondria un par de ventiladores superiores, de las medidas mas grandes posibles, tambien le pondria dos ventiladores delanteros con leds azules (por lo del mod), lo suyo seria que enseñaras la ventana lateral (pero no la que has enseñado, sino la otra)
para los cables.. eso ya depende de la torre y de ti, pero macho, teniendo una fuente modular.., haz una foto lateral para que veamos todo el lio de cables y te voy indicando, esa caja tiene doble fondo? es decir, un hueco por detras de la chapa de la placa base?