Prueba a girar la tele sobre su propio eje con la consola conectada, puede que se trate de interferencias magnéticas provocadas por el propio campo magnético de la tierra, se recomienda orientar las crt cara al sur. Mira tambien a alejar el transformador de la megadrive de la tele, si hace falta usa un prolongador para alejar lo maximo posible lo que es el cuerpo del transformador de la TV.
Todo esto si la tele es CRT, si es plasma, tft o lcd, el problema es sincronismo, tu TV no tiene mucho ancho de sincronismo y no acepta bien el sincronismo de la MD, nada que hacer en este caso.
Suerte.