Si no lo tienes impuesto para embuchado(es fácil de ver, si las páginas están ordenadas, no está impuesto), si además tienes dos hojas por página, lo primero que deberás hacer será separar, hay programas específicos para realizar imposiciones(preps por ejemplo), pero tampoco es estrictamente necesario, el InDesign te permite hacer una imposición sin muchos problemas una vez has montado el libro(sin los rollos de organizar las páginas).
Imprimirlo mejor en copisteria, y ya si le metes las marcas de corte, que te lo corten y grapen allí y te lo llevas finiquitado.xD