Los parches que vienen con los juegos FPKG, es decir versiones "no oficiales" o fixeadas de los juegos pueden venir en varios archivos comprimidos que se descomprimen en el PC y generan único un fichero .pkg. Los parches deben ser para la misma ID que el juego, es decir para la misma zona (Europa, USA, etc), incluso una zona puede estar dividida en varios idiomas. No intentes instalar un parche oficial, por ejemplo descargado de Orbis Patches en un juego FPKG porque no funcionará. Tiene que ser un parche que venga con el juego FPKG.
Y si te vienen varios parches en .pkg una de dos: o son DLCs, o varias versiones del parche v1.01, v1.50, etc o tienen fixes para firmwares anteriores al que soporta el juego. Instala los parches correctos para el firmware que tengas. Sobre las versiones de los juegos, normalmente las últimas versiones incluyen todos los parches anteriores, a no ser que sean parches "delta" que son menos comunes.