Si compilar el programa falla, te sugiero que utilices paquetes de software (RPM, deb etc.). La mayoría de las grandes distribuciones suelen venir con utilidades para paquetes. Éstos contienen información que permite la correcta instalación del programa, además suelen estar probados. Aunque a veces no están disponbles ciertas aplicaciones o las ultimas versiones. Por cierto, qué distribución de Linux usas?