Si cambias el DOL de la ISO por el WAD Installer, pues sí, instalará desde la SD como is lo cargases desde el TH o canal.
Si lo que quieres es instalar directamente el WAD desde DVD, debes reemplazar los archivos de la partición RELSAB por el WAD que quieras instalar, modificar el fst.bin para que solo contenga 1 archivo, y modificar tambien el _update.inf para que solo instale 1 wad.
Es complicado si no sabes por donde van las cosas. Si quieres te puedo preparar una ISO donde solo tengas que reemplazar el WAD con el canal que quieres instalar y hacerle una pequeña modificación al fst.bin.