Pues no sabria que decirte, yo tengo una placa intel 865pe y tengo un disco duro ide y otro ata, desconecté todos los dispositivos y conecte el lector ms25 de mi xbox360 al serial ata que tenia conectado al disco duro.. y todo bien.
Tienes habilitados los puertos serial ata en la Bios?
Otra cosa, tienes que quitar, si es que lo tienes habilitado el modo Raid, de la bios.. la verdad es que esto lo he leido, pero en mi caso no tuve que hacerlo.
En mi caso ni probé si me reconocial el lector ms25, simplemente arranqué con el metodo del disquete y cuando ya estaba en msdos encendí la consola, luego eliges el único puerto ata que tienes.. y te lo deberia reconocer.
Un saludo