Si da algún error al intentar instalar la última versión del HEN, deberías actualizarlo tú manualmente y ya no te saldrá más, al menos hasta que saliese otro más actual.
La otra opción sería tener desconectada la consola de internet, pero quizás la usas para jugar online sin ejecutar el hen.
Ahí ya es decisión tuya.
Edito: no recordaba que existe una opción para evitar esto justamente. Ve a la columna de Red, luego a Hybrid Firmware Tools, luego a Maintenance y dale a X en Toggle Automatic Update.
Ya está, no te volverá a salir ese error y no intentará descargar el pkg del nuevo hen automáticamente.