Has echo la pregunta del millon, jejeje.
Diferencias basicas:
La AES es la version domestica y la MVS es la version de los recreativos. Tecnicamente creo que son similares por no decir iguales. Lo unico que se podria decir en lo que respecta a los juegos es que la aes no tiene continues infinitos.
Luego el tema del precios de los juegos, en AES hay muchos intocables de precio porque hay muy pocas unidades y van muy buscados, pero en formato MVS suelen ser por norma general muy baratos.
Como dicen por aqui, la AES es para coleccionar y la MVS es para jugar.
La neogeo cd, es como una AES pero con "CD", o sea que hay tiempos de carga. No tiene tanto encanto un CD que un cartucho gigante de la AES.
Ahh y los juegos de neogeocd suelen estar muy bien de precio.
Otra "ventaja" que tiene la CD, es que acepta "backups".