Esto lo había escrito antes de saber que era un 5.1 (¿o un 2.1? mientras no digas el modelo...), pero igual le vale a alguien xD
¿Son de los que se apagan girando la rueda de volumen? Esos cascan por ahí siempre tarde o temprano y empiezan a meter ruidos. También puede ser que los condensadores estén fallando, o el circuito de alimentación. Hay altavoces que petardean y no son interferencias, es problema interno.
Mi experiencia con altavoces de PC económicos es bastante mala. Que haya interferencias es bastante improbable, siempre puedes llevártelos a otra habitación y enchufar un reproductor de música o el propio móvil en modo avión reproduciendo algo a ver qué ocurre y sales de dudas.
Siendo un 5.1 o un 2.1, que solo falle uno de los altavoces es bastante sospechoso. Siempre puedes intercambiar frontal y traseros (o derecho e izquierdo) a ver si la "interferencia" se mantiene en su sitio o no, y así vas aislándola. Si se mueve al otro lado es que ese altavoz está mal y tiras de garantía. Aunque si dices que te lo hacen los dos, tiene más pinta del amplificador. En cualquier caso, prueba a llevártelo a otro sitio y conectarle otra fuente de audio.