Bueno, voy a intentar aclarar algunas dudas.
Si habeis visto los esquemas de J1M, su placa tiene un oscilador de 8Mhz, asi que supongo que sus .hex son para esa velocidad, si los grabais en una placa como la que yo puse en el zip original (con 20Mhz) no funcionará.
Las velocidades seguramente podais cambiarlas con el programa de grabar el hex, el divisor de la PLL tiene que ser tal que la velocidad del oscilador entre el divisor sea 4 (para 20Mhz, el divisor es 5, esta en el readme...)
Los bootloaders. El bootloader se graba primero al pic, con un programador. Una vez que esta el bootloader puesto
entonces el hex se puede programar por el USB directamente.