Pues te toca hacerlo manualmente, pero es lo mismo. Sacas los IOS de la iso que sale de dumpear tus originales y después los metes con Wad Manager.
Es que según que juegos tengas tienes que tener unos IOS o no.
Te pongo un ejemplo, ¿de que te sirve el IOS del WiiSpeak si no lo tienes? De nada, ocupa espacio y no tiene función alguna.