Dudo mucho que funcione la verdad, aunque si pruebas tampoco creo que te pase nada. Yo en su momento probé con mi R4 de DS a ver si funcionaba en la 3DS y la 3DS no la reconocía. Para jugar a backups de DS en 3DS tendrás que hacerte con una flashcart compatible, como por ejemplo la R4i SDHC (es la que uso yo). Su precio ronda los 12-15€, así que está baratita.