Oficialmente la pronunciacion de "lluvia" es /yubia/. Aunque dependiendo de la zona donde se viva y el idioma que se hable, podra tirar a otra variante, lo cual es totalmente valido, pero el estandar es la /y/.
Sobre el post de IKnewthat, los idiomas cambian, y el español no es una excepcion, la "LL" antiguamente tenia una pronunciacion propia, pero actualmente se esta desfonologizando hacia la /y/, y eso es un cambio irremediable, la excepcion son los que pronuncia la "LL" como antiguamente. Un ejemplo de este cambio es la homofonia (pronunciacion igual) entre "V" y "B", siendo siempre /b/.