No, no es normal, deberían de apagarse al apagar la 360.
Tiene pinta de que estás dando sobrevoltage al modulo RF (y no sé, pero como acabes por dañarlo... aunque igual ya está dañado y por eso necesita ese voltage adicional...), después de todo lo que has hecho, yo dejaría el modulo RF tranquilo, quitaría ese puente y soldaría el tema del JTAG en el punto que va a dicho modulo (el que está detrás de la placa en lugar del que estás usando del modulo RF [si es que finalmente lo estás usando, y no son imaginaciones mías])