Ademas de los que te han dicho, te dejo algunos.
El Zombies, esta para las dos y es un hueso duro de roer, pero muy divertido.
Tambien el Smash TV, tiros y cachondeo.
Luego exclusivos de SNES tienes algunos cooperativos increibles:
Mistical Ninja (zonas de plataformas matando enemigos, zonas tipo RPG, minijuegos, tiendas.. mucho cachondeo). Si un jugador es mas malo que el otro en zonas concretas (como las de plataformas) Puede subirse a la espalda del otro jugador y que este lo lleve (algo muy recomendable si juegas con alguien que tenga poca experiencia).
Goof Troop. Has de superar los niveles intercambiando objetos, eliminando enemigos y resolviendo puzzles. Al final de cada mundo, un jefe te espera. A 2 jugadores es muy chulo.
Troddlers (llevas a dos magos que han de meter a unos "lemmings" en la salida, a base de guiarlos creando y quitando plataformas con forma de cubo). Al principio cuesta pillarle el truco, pero luego es la leche.
Super Tekkyu Fight, juego de esos de pasar niveles de pantalla fija y cada x pantallas te cargas a un jefe. LLevas a heroes japoneses (ULtraman, Gundam, Kamen Rider) y pegan con bolas y cadenas.
Otoboke Ninja Colosseum, como el Bomberman pero con ninjas que ponen bombas de Shurikens y usan una bola con cadena para eliminar a los enemigos. Tiene modo multi y un modo historia cooperativo para los dos.
Run Saber de acción y plataformas tipo Strider, pero con 2 players.
Slam Masters, en SNES puedes jugar el modo 2 vs 2, ambos players pueden ir en el mismo equipo y os pasais el juego juntos, mola mucho.