Tengo una pc similar a la tuya, salvo por la placa de video (la mia es gtx 560 ti)
El tema del 3d, la verdad, se complica cuando más lo usas. Llevo casi un año con él, y mis ojitos se están acostumbrando, al comienzo jugaba con una profundidad de 25%, actualmente casi 90%, y cada vez noto menos diferencia.
De los juegos que se ven muy bien con el 3d, los tengo en steam:
CALL OF DUTY BLACK OPS
CLIVES BARKER JERICHO
ALICE MADNESS RETURN
BATMAN ARKHAM ASYLUM
TOMB RAIDER UNDERWORLD
THE BALL
SUPER STREET FIGHTER IV ARCADE EDITION
RESIDENT EVIL 5
TRINE
UNREAL TOURNAMENT 3
ZOMBIE DRIVER
FEAR 2
ALIEN BREED IMPACT
ALAN WAKE
DEUS EX HUMAN REVOLUTION
ALIENS VS PREDATOR
CALL OF DUTY MODERN WARFARE 2
BORDERLANDS
TEAM FORTRESS 2
CRYSIS 2
SPEC OPS THE LINE
Tengo un montón más, pero no pude probar hasta ahora y andan muy bien en general.
Hay juegos de la lista que te puse que tienen problemas con la "MIRA DE APUNTAR", cuando quieres enfocar, como que no puedes. Para ello puedes usa la mira láser de nvidia (CTRL + F12), pero la verdad, es un poco molesta. Asi que prefiero jugar sin enfocar la mira de apuntar, sino los enemigos.
He probado otros juegos, pero realmente se producen como sombras, y te distorsionan la vision, y en ese caso, desactivo el 3d, tal es el caso de BIOSHOCK 1, y GTA IV.