Si los juegos que tienes en cd, pasan de los 72 minutos, no te va a cargar ninguno, ya que ese es el tiempo del ar2 o toc, como normalmente se llama. Esos juegos los tienes que parchear, y no es que haya un programa especifico que lo haga, si no que cada juego tiene su parche, en el cual te explican como aplicarlo.
Lo del ps2 reality media player, probablemente es que no los has grabado bien. Lo tienes que grabar en cdrom-xa, modo 2, que es el sistema que la ps2 reconoce.
Espero haberte ayudado.
Suerte.