Sí que se puede, puedes tener unos juegos en una y otros en la otra.
Pero tampoco es muy práctico, las tarjetas SD no son cartuchos, no se pueden meter con la consola encendida, ¿no es mejor que la nueva tarjeta tenga suficiente capacidad para todos los juegos? Si por ejemplo, tienes una tarjeta de 256 GB y se te empieza a llenar, es tan fácil como comprar una de 512 GB, vender la antigua, y ya tienes todo en la misma tarjeta.