Que yo recuerde la única "limitación" era la lentitud de escritura (utiliza wine con el propio driver ntfs.sys) por lo que pasar Gigas sin más debe ser un suplicio. Al principio tenían que coincidir el nombre del fichero y el tamaño, pero yo he visto utilizarlo sin problemas (eso sí, ficheros de tamaño razonable en cantidades razonables).
Saludos.