No, no es compatible.
Otra cosa sera si hablamos de los programas en Fenix que rularan en GP2X sin cambios o los que usen SDL, que solo tendran que ser recompilados (en un principio).
El resto de programas... pues como que no rularan a no ser que sean portados. Si lo preguntas por los emus te dire que no debes preocuparte ya que tendras los principales practicamente al poco de salir la maquina y su SDK. Si preguntas por los juegos homebrew... quitando los de Fenix, dependera de que sean portados (mejor o peor); obviamente no saldra todo lo que hay en GP32 para la GP2X.