Que hayas aprobado el examen practico no significa que automaticamente tengas carne, tu de momento has aprobado un examen y punto, hasta que no tengas documentacion en regla para poder conducir no puedes coger un coche. Por lo que, el guardia civil ha hecho bien, aunque si no constaba si quiera que tuvieras carne, dejo que siguieras tu camino, deberia haberte inmovilizado el coche, no entiendo nada.
Una cosa es que se te haya olvidado el carne, y con el dni, pueden comprobar si tienes el carne en regla, pero otra cosa es que te pillen con un coche y sin carne, y no te hagan nada, por lo pronto, no se si te van a quitar puntos ya...