Respecto al LED, ni idea, pero veo complicado poder soldar un led a algún punto de la placa. Se me ocurre que hay leds usb. No los he usado nunca y no se como funcionan, pero imagino que se podrán programar de alguna manera (script sencillo) para que se enciendan o apaguen a voluntad.
Respecto al interruptor, en su día usé un cable usb a microusb con interruptor, pero no debía ser de calidad porque me aparecía con mucha frecuencia la señal de pérdida de energía, y pude comprobar que no era cosa del alimentador sino del cable. Puede que el alimentador estuviera en el límite y con uno mejor puedas mitigar el problema del cable.
Lo que si debes saber es que apagar a las bravas la Raspberry te puede generar problemas con los datos de la tarjeta SD, por lo que es más que recomendable que apagues por software primero la Raspberry (p.e. con EmulationStation si es el frontal que usas) y una vez apagada, le quites la corriente.
La caja NESPI tiene un botón de reset y otro de power, pero no tienen controlado ese problema. Hay mods para esta caja que permiten pasar una señal (por GPIO; no te valdría) a la Raspberry para hacer un apagado lógico y ralentizar el apagado de la corriente.
Pero si no puedes usar GPIO, tendrías que ir a la solución del cable microusb.