dependiendo del soporte, en mi disco duro (320gb 2.5 usb) es mucho mas lenta que HFS.
Comprobado varias veces.
En cuanto a pendrive, pues cuanto menos espacio es mas rápido ntfs...
en principio al no tener soporte nativo de ntfs tiene que pasar por un software externo para leerlo, con lo cual supongo que al ser mas grande la cantidad de datos que tiene que interpretar el software 320 Gb por ejemplo.
es a lo que yo se lo achaco