Pues no... tu cartucho aunque es basado en DSTT no usa los mismos archivos, tienes varias opciones, puedes usar el YSMenu (a mi no me gusta), puedes usar el moonshell para ejecutar los juegos (practicamente es como el YSMenu pero con una mejor interface) o puedes usar tu sistema operativo original y desde el ejecutar el moonshell y ejecutar los juegos.
Yo en mi R4i Gold Upgrade lo tengo solo el moonshell... al entrar al cartucho entra directo al moonshell y desde allí cargo los juegos, videos, musica, etc.
Tambien tengo el R4i-SDHC (no es el mismo que tu tienes) pero con este lo tengo con el sistema operativo original y con el moonshell aparte porque el sistema operativo del R4i-SDHC puede ejecutar algunos juegos que con el moonshell no puedo.
Dime si quieres intentar con alguna de estas opciones y si quieres dime cual quieres y más tarde te subo el sistema operativo y te lo mando por MP para que lo cheques.
Saludos!!!