Empecemos por lo primero:
EOL NO da soporte a juegos bajados de Internet, EOL esta en contra de la Pirateria!
Como bien comenta
josete2k has el Backup a partir de tus originales! y grabalos a 4x en discos de calidad (Verbatim son los recomendados)
Ahora vamos al problema.
Según entendí, antes te funcionaban los Backups con un Modchip viejo hasta que lo cambiaste por otro (mas actual) por el tema del New Super Mario Bros. ¿es esto correcto?
El problema se puede derivar de la siguiente forma.
1 Que los juegos bajados de Internet (Piratería) estén parcheados o truchados y que necesiten que el IOS con el cual trabajan, también este parcheado con Bug Trucha. (Esto soluciona parcheando dicho IOS) usar iospatcher v1.1 para saber que IOS parchear y Dop-IOS v8 para Parchearlos (buscar info de como usarlos aquí en EOL)
2 Que los juegos bajados de Internet (Piratería) estén parcheados o truchados y que sean de otra región, quizá en el nuevo Modchip que te instalaron, no esta habilitada la opción para la carga de juegos de otra región, (consulta a tu instalador de Mochips) aunque esto te ayuda para evitar bricks y semibricks, además de que evita la instalación de canales repetidos.
Intenta instalar el cIOS de Waninkoko v14 y con el Wad Manager de Waninkoko instala el
canal del Neogamma y carga desde ahí los discos, deberían de funcionar porque deberían.
Si a todo esto falla, quizá tengas un IOS dañado o mal instalado, actualiza tu consola de forma oficial a la 4.2 y sigue este
tutorial para dejarla con Homebrew.
Después de esto comentas el resultado.
Saludos!!!