Me parece que estas un poco confundido, no necesitas la linea de comandos de Windows para instalar Linux.
Lo primero que debes hacer es decidirte por una version, a titulo personal te recomiendo Ubuntu, que funciona muy bien.
Te digo un poco como empezar, te recomiendo que lo pruebes a ver si va bien antes. Para probarlo vamos a usar un Live-CD que te puedes bajar de
aqui o bien de
aqui si tienes un procesador de 64 bits tipo AMD-64
Quema la iso en un CD con algun programa tipo Nero y con el CD en el lector del ordenador reinicia tu sistema. Te saldra un menu muy facil a seguir y te acabara cargando una Ubuntu desde el CD, sin instalarte nada en el disco duro. Ahi comprueba si todo funciona bien, tipo la tarjeta de red, el wifi y esas cosas.
Si te convence, entonces bajate
esto o bien
esto para 64 bits
y lo mismo quemas el CD y reinicias con ese CD dentro, te cargara el instalador de Ubuntu y puedes encontrar instrucciones precisas [url=http://]aqui[/url].
Una vez tengas instalado todo te recomiendo te pases por
aqui para tunear y tal.