El Wubi es una "kk" jeje, lo mejor es que lo instales en una particion para el solo, como dios manda.
Una cosilla mira a ver de entrar en Windows y hacer un chkdsk /f /r a ver si se arregla (que no creo) y luego volver a arrancar el Mint. otra cosa, parece que en particiones FAT32 tambien tiene problemas el wubi (no si la tendras en fat32, pero por si acaso te aviso).
Salu2!